Награды писателя
1993 - "Аэлита" - премия "Старт" (за лучшую дебютную авторскую книгу молодого автора) - за сборник "Атомный сон".
1995 - "Интерпресскон" - премия "Интерпресскон" в номинации "Малая форма" - за рассказ "Фугу в мундире".
1995 - "Сибкон" - жанровая премия "Меч Руматы" (за лучшее произведение героико- романтической фантастики) - за роман "Рыцари Сорока островов".
1996 - "Интерпресскон" - премия "Интерпресскон" в номинации "Малая форма" - за рассказ "Слуга".
1997 - "Странник" - жанровая премия "Меч Руматы" (за лучшее произведение героико- романтической фантастики) - за дилогию "Императоры иллюзий".
1998 - Первый Московский форум фантастики - премия "Сигма-Ф" - за роман "Осенние визиты".
1998 - "Зиланткон" - премия "Большой Зилант" - за роман "Лабиринт отражений".
1999 - "Аэлита" - премия "Аэлита" за общий вклад в развитие отечественной фантастики.
1999 - "Странник" - премия "Странник" в номинации "Крупная форма" - за роман "Ночной Дозор".
1999 - "Звездный мост" - премия "Серебряный кадуцей" в номинации "Циклы, сериалы и романы с продолжениями" - за роман "Фальшивые зеркала"; премия "Серебряный кадуцей" в номинации "Крупная форма" - за роман "Ночной Дозор".
2000 - "Интерпресскон" - премия "Интерпресскон" в номинации "Крупная форма" - за роман "Фальшивые зеркала".
2000 - "Звездный мост" - премия "Золотой кадуцей" (совместно с Владимиром Васильевым) в номинации "Циклы, сериалы и романы с продолжениями" - за роман "Дневной Дозор".
2001 - "РосКон" - премия "Золотой РосКон" (совместно с Владимиром Васильевым) в номинации "Художественные произведения" - за роман "Дневной Дозор".
2001 - "Интерпресскон" - премия "Русская фантастика" за дилогию "Искатели неба".
2001 - "Литуаникон" - диплом фестиваля за 1-е место в номинации "Лучший роман зарубежного автора + лучший перевод на литовский" - за роман "Лабиринт отражений" в переводе Гинтаса Иваницкаса (Литва, Каунас).
2001 - "Звездный мост" - премия "Серебряный кадуцей" в номинации "Циклы, сериалы и романы с продолжениями" - за роман "Близится утро".
2001 - "Странник" - премия "Странник" в номинации "Малая форма" - за рассказ "Вечерняя беседа с господином особым послом".
2002 - "РосКон" - премия Кира Булычева "Алиса" (вручается за лучшее детское научно-фантастическое произведение) - за роман "Танцы на снегу".
2002 - "Интерпресскон" - премия "Интерпресскон" в номинации "Малая форма" - за рассказ "От судьбы".
2003 - "РосКон" - премия "Золотой РосКон" в номинации "Романы" - за роман "Спектр"; премия "Серебряный РосКон" в номинации "Повести, рассказы" - за повесть "Пограничное время". Премия "Бронзовая улитка" за роман "Спектр".
2003 - "КиевКон" - премия "Большая Урания" за роман "Спектр".
2003 - Московский форум фантастики - премия "Сигма-Ф" (приз читательских симпатий журнала "Если") в номинации "Роман" - за роман "Спектр".
2003 - "Интерпресскон" - премия Бориса Стругацкого "Бронзовая улитка" в номинации "Крупная форма" - за роман "Спектр".
2003 - "EuroCon-2003" - Сергей Лукьяненко признан лучшим писателем-фантастом Европы.
2003 - "Звездный мост" - премия "Золотой кадуцей" в номинации "Крупная форма (романы)" - за роман "Спектр".
2005 - "Странник" - за цикл "Дозоры"
2007 - Мюнхен - премия Corine в номинации «Лучшая детская и юношеская книга» за роман "Танцы на снегу"
2008 - премия Курда Лассвица как лучший зарубежный роман за роман "Спектр"
2009 - «Орден рыцарей фантастики» имени Игоря Халымбаджи
2010 - Премия имени Александра Грина
и многие другие
2010 - Премия "Странник" Меч «Рыцарь фантастики»